Provient d'un bug introduit par la compilation des messages d'erreur en anglais dans mysqld.exe lui-même. On ne peut plus utiliser lc-messages= dans my.ini, sinon plantage.
Donc, je recompile les installeurs en supprimant toute référence à lc-messages. Du coup, ça me simplifie la vie, je n'ai plus à gérer la langue des messages d'erreur.